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Azure AD Connectのインストールウィザードを進めると最後に以下の画面が表示されます。この画面に「構成が完了したら、同期プロセスを開始する」というチェックボックスが有ります。通常のインストールであれば特に問題無いですがステージングモードでインストールする際にこのチェックボックスにチェックを入れて良いかどうか迷ったことはないでしょうか。
結論、同期プロセスを手動で実行する為このチェックボックスのチェックを外してインストールを実行しましょう。