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はい。復旧用MicrosoftアカウントがあればMicrosoft Authenticatorアプリのアカウント資格情報をバックアップ、復旧が可能となります。
https://docs.microsoft.com/ja-jp/azure/active-directory/user-help/user-help-auth-app-backup-recovery
ただし、職場または学校アカウントの資格情報については再度、組織が提供するQRコードをスキャンする必要があります。