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NAT Gatewayではサブネット内の仮想ネットワークを1つだけ関連付けることができます。仮想ネットワークが複数存在し、NAT Gatewayを利用したい場合には、仮想ネットワーク分だけNAT Gatewayが必要となります。
Virtual Network NAT とは – 制限事項
https://docs.microsoft.com/ja-jp/azure/virtual-network/nat-gateway/nat-overview#limitations
NAT を複数の仮想ネットワークにまたがって使用することはできません。