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OneDrive との連携が可能なマイクロソフト社非純正アプリに対し、制限をかける場合は OneDrive 管理センターから設定を行うことが可能です。
制御の詳細につきましては、下記 URL をご参照ください。
なお、設定に際しては Microsoft Intune または Enterprise Mobility + Security ライセンスが必要となります
[OneDrive および SharePoint モバイルアプリの機能へのアクセスを制御する]
https://docs.microsoft.com/ja-jp/onedrive/control-access-to-mobile-app-features?redirectSourcePath=%252farticle%252fd25713bb-5cf8-4874-9b5b-e8bee3b94f13