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グループポリシーを使用することで、組織全体で個人の OneDrive アカウントを OneDrive for Business クライアントで同期できないようにすることが可能です。

[グループ ポリシーを使用し、OneDrive 同期クライアント設定を制御する]
・「Prevent users from syncing personal OneDrive accounts (ユーザーが個人用の OneDrive アカウントを同期できないようにする)」 項をご参照ください。
https://docs.microsoft.com/ja-jp/onedrive/use-group-policy#DisablePersonalSync

なお、設定後に個人の OneDrive アカウントでのサインインを試行した場合「このコンピューターの個人用 OneDrive の同期は、組織で許可されていません」のメッセージが返される動作となります。