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現状、Azure ではシステムのインプレース アップグレード に対応していません。
推奨の方法および手順としては、以下公開情報「回避策」に記載されている通り、
新規で仮想マシンを作成し、新規で作成した仮想マシンへデータの移行を実施することをご検討ください。
[Windows Azure の Vm では、システムのインプレース アップグレードはサポートされていません ]
https://support.microsoft.com/ja-jp/help/4014997/an-in-place-system-upgrade-is-not-supported-on-windows-based-azure-vms