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Azureで永続データの保存に使用されるBLOBストレージには、保存コストに優れる「ブロックBLOBと」ランダムアクセス性能に優れる「ページBLOB」の2種類があります。このうち仮想マシンディスクとして使用されるのはページBLOBになりますので、ページBLOBの利用料金が適用されます。実際の利用料金につきましては以下のページよりご確認ください。
http://azure.microsoft.com/ja-jp/pricing/details/storage/

また仮想マシンディスクの利用料金は、ディスク自体の最大容量ではなく、その時点でディスク上に保存されているデータ量に対して発生します。例えば、Windows仮想マシンのOSディスク127GBのうち30GBが使用済みの場合、30GB分の利用料金が発生します。