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必ずしも自動で適応されるわけではありません。

作成した仮想マシン（ゲストOS）については、オンプレミス環境同様に利用者の設定によって自動で適応されるかどうかが決まります。

Azure では仮想マシンが動いている基盤（ホストOS）はメンテナンスとして事前通知のもとパッチが適応されています。なお、ホストOSのアップデートにおいて強制的に再起動が発生する場合があります。再起動発生時にもサービス提供に影響がないように可用性セットの設定をすることが推奨されています。

[仮想マシンのメンテナンス作業に伴う一時停止について]
https://blogs.msdn.microsoft.com/dsazurejp/2013/10/10/253/