Power Automateの手動実行と自動実行の違いは下記です。
手動実行・・・Power Automateで実行ボタンをクリックしたり、トリガーのアクションを実行することでフローを動かします。
自動実行・・・1回以上動かしたことのあるフローが過去の履歴から選択でき、トリガーを再利用することができます。
例えば、Sharepointリストの「項目が作成されたとき」というトリガーを設定している場合、1度実行したことのあるトリガーを使用してフローを動かすことができるため、改めてSharepointリストに項目を追加せずにフローを実行することができます。