PublicIPアドレスBasicの廃止に伴う影響はありますので、PublicIPアドレスStandardへ移行する必要があります。

移行については、AzureポータルにてGateway SKU Migrationツールが利用可能です。
なお、ExpressRoute Gatewayで利用されているPublicIPアドレスはAzureの基盤側にてExpressRoute Gateway を管理する目的でのみ利用されます。
その為、IPアドレスが変更されてもユーザー影響はありません。
既存のPublicIPアドレスBasicを利用せず、新規でPublicIPアドレスStandardをデプロイした上でMigrationツールを実施すれば移行をスムーズに実施することが可能です。