管理者権限のあるアカウントにて Microsoft 365 管理センター上での確認が可能です。

全ユーザーのメールボックス使用容量を確認する方法

1. 管理者権限で Microsoft 365 管理センターにアクセスします。
2. [レポート] – [利用状況] – [メールアクティビティ] – [さらに表示] をクリックします。
3. [メールボックスの使用状況] タブをクリックします。

こちらで全ユーザーの利用状況を一覧で確認、エクスポートが可能です。

一覧上に表示されるユーザー名について、既定ではプライバシー保護のためユーザー情報を非表示としています。
ユーザー情報を一覧上で表示させるためには、テナント上でレポートのプライバシー保護の設定を解除する必要があります。
参照：管理者で確認する使用状況レポートにユーザー情報が表示されない